先日とりかかった件、何回か試して変更が反映されるやり方がわかりました。変更を加える対象のファイルを間違えていたというものでした。
Pelican 本体のディレクトリの中にテーマファイルがありますが、その中の notmyidea という方がデフォルトのテーマだったようです。 templates の中の適当なファイルに先のエントリに載せたような html を加えてビルドすると無事タグが表示されました。
site-packages/pelican/themes/notmyidea/templates/base.html
今回は base.html に書きました。
ただ、タグのページの設定をしていないため、タグをクリックしてもリンク切れとなってしまいます。このあたり、もう少し調べて対処しなければいけませんね。手がかかるので面倒というふうに思わなくもないですが、いろいろいじることができるので勉強にもなりそうです。
Pelican が使っているテンプレートエンジン Jinja2 についてももう少し調べようと思います。